iTunes sólo es compatible con iPod, por lo que si tenemos otro reproductor MP3, tenemos que coger la música de iTunes con otro programa para usarla en nuestro MP3. Sin embargo, con iTunes Agent podremos sincronizar la música de iTunes con cualquier reproductor que reconozca nuestro ordenador.

Además, ofrece compatibilidad por defecto con los teléfonos móviles Sony Ericsson que tengan función Walkman y con la consola PSP.